Anthropic Says It Discovered a Crispr-Like System. Now What?

TL;DR · AI 摘要
Anthropic声称其AI模型发现类似CRISPR的基因编辑系统,但科学界对其实际价值持谨慎态度。
核心要点
- Claude模型在21.5小时内筛选出20万+逆转录酶候选对象
- 斯坦福教授称该发现'PR先于实验',需进一步验证
- 新系统ART可能具备DNA切割/复制能力但尚未确认
结构提纲
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思维导图
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- AI发现新基因编辑系统
- 发现过程
- Claude模型筛选逆转录酶
- 锁定ART家族
- 科学界反应
- 部分专家质疑验证不足
- 需物理实验确认功能
金句 / Highlights
值得收藏与分享的关键句。
950个Claude代理在21.5小时内完成20万+逆转录酶筛选
斯坦福教授Le Cong称'AI找到闪亮物体,但需实验室验证是否为钻石'
Anthropic称ART系统可能具备DNA切割/复制能力但尚未确认
Anthropic称发现类似CRISPR的系统。接下来会怎样? | WIRED
Emily Mullin
Anna Rogers
科学
2026年9月29日 下午2:03
Anthropic称发现类似CRISPR的系统。接下来会怎样?
“实验还在排队中,公关稿已经发布。”一位专家表示。
图片插画:WIRED编辑部;Getty Images
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科技高管们长期以来一直吹嘘他们的AI模型有潜力加速生物学研究的进程。上周,他们宣布实现了这一目标。在9月23日的声明中,Anthropic声称其大型语言模型Claude识别出了一种具有“类似CRISPR特性”的酶系统,而CRISPR是获得诺贝尔奖的基因编辑工具。
根据Anthropic的说法,大约950个Claude代理同时运行,在21.5小时内发现了这些有趣的基因序列。“我真诚地称赞Anthropic向世界公开他们的发现。”加州大学伯克利分校的基因编辑专家、创新基因组学研究所(IGI)治疗研发主任Fyodor Urnov表示。(IGI与Anthropic有合作,但并未参与此次新发现。)
其他科学家对这一发现则显得不那么热情,这是Anthropic今年早些时候成立的研究小组首次公布成果。“实验还在排队中,公关稿已经发布。”斯坦福大学专注于将AI整合到基因组工程研究的教授Le Cong表示。
已经建立药物发现湿实验室的Anthropic明确表示,这一发现并不是他们工作的终点。(该公司在X平台上发文称:“我们尚不清楚这个系统的作用,但只有少数已知系统具有类似的特征,而所有这些系统都能切割、复制和粘贴DNA。”)一份技术报告中包含了一个物理实验,但尚未经过同行评审。然而,要确定这一发现的重要性,还需要做大量工作。目前尚不清楚这种酶系统是否能作为基因编辑工具使用,如果能,它是否是一个有用的基因编辑工具。
“假设我们正在圣莫尼卡海滩上,试图在所有沙子中寻找一颗钻石,”Cong表示。“AI发现了一个看起来非常闪亮的东西,然后你必须回到实验室确认——这是玻璃吗?是钻石吗?”
在Anthropic的研究人员提示Claude搜索巨大的基因组数据库,寻找“有趣的新例子”逆转录酶(将RNA复制成DNA的蛋白质)后,Claude发现了这个闪亮的物体。这与我们细胞中的正常过程相反,正常情况下DNA被转录成RNA,但其他生物体则利用这一过程进行多种生物功能,包括插入DNA片段。
据Anthropic称,Claude代理最初识别出超过20万个可能的逆转录酶,随后在挑选出数千个看似新的酶后,进一步缩小范围,最终发现了一个包含长段重复DNA序列的“不寻常”逆转录酶家族,这些序列类似于CRISPR。Anthropic将这个系统命名为ART,即与阵列相关的逆转录酶。该系统存在于巨型噬菌体中,这是一种感染细菌的巨大病毒。
“我用肉眼能看到一个串联重复序列……这看起来像是一个类似CRISPR的重复序列?!”AI代理写道。该代理还承认,根据技术报告,这个系统可能是一个retron。CRISPR和retron都是细菌的免疫系统,尽管retron在基因编辑方面有一定用途,但它们并不是像CRISPR那样的多功能工具。因此,Anthropic博客强调CRISPR类比并不令人意外。
Gladstone研究所的高级研究员Seth Shipman认为Anthropic发现的并非新的CRISPR系统,但他表示这一发现仍然具有意义。“新颖之处在于他们发现它的方式,而不是它本身是什么,”他说。他的实验室曾利用retron开发基因编辑系统,因此这种用法是可行的。
识别新的逆转录酶通常需要数月时间手动挖掘基因组数据库,因此Shipman表示Anthropic能在一天内完成这一过程令人印象深刻。但他警告不要将这一发现完全归功于AI模型。“我认为我们应谨慎地说Claude自主发现了某物,因为研究中涉及科学家的参与,”他说。
事实上,这种相同的逆转录酶在2021年德克萨斯A&M大学的微生物学家Jason Gill及其同事关于巨型噬菌体的论文中已被发现。或许新的发现是Claude识别出该酶周围存在重复序列,暗示这种酶可能属于类似CRISPR的系统。
Gill表示:“这些模型在发现模式方面表现优异,比人用肉眼盯着看更有效。”他补充说,人工虽然也能完成这些工作,但需要事先有明确的假设。“ART似乎与任何已知的CRISPR系统都没有明显的关联,证明它确实具有基因编辑活性的任务仍落在Anthropic身上。”
Cong称赞科学家们找到了适合Claude处理的完美问题,这得益于其模式识别能力。该模型可能用于其他大型数据项目,但这并不意味着Claude会突然加速生命科学领域的各类发现。
科学界无法评估该模型训练所用的数据类型,这在当前主要期刊要求科学家公开代码以确保可重复性的时代,使得这些发现显得异常模糊。这也让一位研究这些酶的科学家对模型是否使用了他的工作产生怀疑,因为他曾向Claude的公开版本分享了尚未发表的发现。(Anthropic向《纽约时报》表示:“Claude并未使用任何用户转录数据进行训练,我们的分子生物学团队也没有这样的访问权限。”)
即使Claude确实发现了基因编辑领域的下一个重大突破,仍需人类科学家在实验室中验证这一假设。在X平台上关于这一发现的帖子中,Anthropic首席执行官Dario Amodei表示:“最终,Claude甚至可能通过自主控制实验设备来安全地执行实验。”即使这成为可能,也将在相当遥远的未来。(当然,这一想法引发了关于安全性和监管的诸多问题,Amodei随后补充说,Anthropic的实验室处于最低生物安全级别,因此不包含对人类造成重大伤害的物质。)
在这一领域的答案不会来得很快。从1987年首次在细菌中发现CRISPR序列,到2012年Jennifer Doudna和Emmanuelle Charpentier证明其可以作为可编程工具切割DNA,这一过程耗时25年。尽管如今CRISPR技术已广泛应用于实验室,并在数十项临床试验中被用于治疗心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病和罕见疾病,但截至目前市场上只有一种基于该技术的药物获批,时间为2023年底。这印证了科学进步的漫长历程——以及将有前景的基础科学研究成果转化为药物所面临的困难。
Anthropic研究的局限性也揭示了一个更根本的问题。使CRISPR革命性的是科学家发现了一个此前未知的生物系统。目前尚不清楚任何AI模型是否能在不明确具体目标的情况下发现有用的东西。
"如果你有一个AI,它仅接受在人们发现CRISPR之前的知识进行训练,然后这个AI实际上发现了CRISPR,这似乎是一个更好的测试AI科学家的设定," Cong表示。